A Montenero di Bisacciából induló, 149 kilométeres hegyi befutós szakaszon egyetlen nagyobb emelkedőt, a Blockhaust kellett megmásznia a mezőnynek. A hegy aljánál bukásba keveredett a verseny esélyesei között számontartott brit Geraint Thomas, aki egy rosszul parkoló rendőrmotoros miatt esett el több társával együtt, így ötperces hátránnyal ért célba. A 13 kilométer hosszú emelkedőn a címvédő Vincenzo Nibali első számú kihívója, a kolumbiai Nairo Quintana együttese, a Movistar állt az élre, és az általa diktált tempót alig néhányan tudták tartani. Qunitana először 6,5, majd 5,8, végül 4,4 kilométerrel a cél előtt váltott iramot, ez utóbbit pedig Nibali és az egyébként nagyszerűen tekerő, másodikként célba érő francia Thibaut Pinot sem tudta tartani. A 2014-es Giro-győztes kolumbiai végül közel félperces előnnyel nyerte a szakaszt, amelyen Pinot mögött a holland Tom Dumoulin végzett a harmadik helyen. Nibali egyperces hátránnyal ötödik lett.
Az összetettben is Quintana, Pinot, Dumoulin a sorrend, az eddigi éllovas luxemburgi Bob Jungels három és fél perces hátránnyal ért célba.
Az eredmény:  9. szakasz (Montenero di Bisaccia–Blockhaus, 149 km): 1. Nairo Quintana (kolumbiai, Movistar) 3:44:51 óra, 2. Thibaut Pinot (francia, FDJ) 24 másodperc hátrány, 3. Tom Dumoulin (holland, Team Sunweb) azonos idővel  az összetett élcsoportja: 1. Quintana 42:06:09 óra, 2. Pinot 28 mp hátrány, 3. Dumoulin 30 mp hátrány.
A május 28-ig tartó versenyen ma szünnap lesz, holnap a Foligno és Montefalco közötti 39,8 kilométeres egyéni időfutam vár a mezőnyre.