Az Európai Nemzetiségek Föderatív Uniója (FUEN) aggodalmát fejezte ki a zászlóügy kapcsán kialakult román–magyar vita miatt, és kijelentette: az államoknak nem szabad a kisebbségek kárára vitatkozniuk. A FUEN szerint elfogadhatatlan a székely zászló használatának romániai tiltása.
Az európai nemzeti kisebbségek ernyőszervezete összefoglalta a román–magyar zászlóháború történetét. A 32 európai ország 94 szervezetét tömörítő FUEN dél-tiroli alelnöke, Martha Stocker által aláírt nyilatkozat megállapítja, hogy a román hatóságoknak a székely zászló betiltására irányuló kísérletei erős tiltakozást váltottak ki a magyar kormány részéről, s ezzel Budapest nemzetközi szintre emelte a kérdést.
A FUEN közleménye szerint a Fidesz gyakran a határon túli magyarok szószólójaként lép fel, ami Magyarország és Románia viszonylatában különösképpen kényes, hiszen Budapest olyan témákat tart napirenden, amelyek nem minden esetben esnek egybe a romániai magyarság legitim képviseletének érdekeivel. A székely zászló használatát azonban engedélyezni kell Romániában, „európai kisebbségi jogi távlatból minden más megoldás elégtelen volna”. Martha Stocker úgy véli, ilyen kérdésekben az Európai Uniónak a kisebbségek védelmezőjeként kellene fellépnie. A FUEN jelezte: támogatja a romániai magyarság közösségi és politikai érdekképviseletét ellátó RMDSZ-t és annak több évtizedes kisebbségvédelmi politikáját. Az ernyőszervezet szerint a most zajló román–magyar nézeteltérések ismét rávilágítanak arra, hogy Európának foglalkoznia kell a nemzeti kisebbségek kérdéskörével, úgy ahogy azt a FUEN és partnerei – köztük az RMDSZ – a készülő kisebbségi európai polgári kezdeményezéssel célozzák.
